上海高等研究院王鹏课题组在nature communications期刊发表论文
打印“大数据时代”如何运用多组学分析手段有效寻找癌症病因，是当今国际科研界的重要前沿。近日，中国科学院上海高等研究院王鹏课题组的研究人员独立开发了一种全新的算法SIMBA，整合人类前列腺癌多组学数据，成功建立了具有表达互斥特征的、以AR、HOXC6 和NKX2-2 为核心的转录因子-microRNA 基因调控网络，并结合多种生物信息学分析手段，揭示了这三个转录因子可共同调控重要microRNA，进而操控细胞浸润、转移进程的生理机制。该项研究成果不仅从基因组水平上解释了前列腺癌病人中雄激素疗法的耐药性问题，还为前列腺癌病人的精准治疗提供了新的思路。相关论文已发表于最新一期的国际著名期刊nature communications（2017），8：14917（一区期刊，影响因子11.329）。
据了解，癌症是一种高异质性的疾病，不同病人基因组上的差异可导致癌症发生、发展进程的差异。因此，中国和美国不约而同地启动了依据病人基因组特性和癌症多组学大数据，精确寻找病因和治疗方案的“精准医疗计划”，此项研究正是响应国家“精准医学计划”的号召下成功开展的，并得到了国家自然科学基金、上海市科委“探索”类项目和中科院“BR计划”的支持。
