主要职责：负责统筹协调行政综合事务、基本建设及后勤保障等工作
主要职责：负责党的建设、全面从严治党、纪检监督、干部队伍建设等工作
主要职责：党风廉政建设和反腐败工作的组织协调，监督检查党风廉政建设责任制落实情况；对党员和行政监察对象执行党纪法规情况进行监督和管理；开展廉洁从业及科研诚信宣传教育工作；组织、协调与实施高研院及其下设单元的内部审计工作；接受检控类来信来访；调查处理违纪问题，落实“四种形态”等。
主要职责：规划编制、科技管理体系、科技业务、学术委员会、科研道德与学风、科学传播、国际合作、因公出访、英文网站及境外宣传、质量体系、保密工作、仪器平台、分析测试等。
主要职责：人力资源规划、机构及岗位设置、人员招聘流转、劳动关系、薪资福利、考核、培训、继续教育、实习生、博士后及流动站、人才项目、涉密人员出入境、因私出入境、落户申报、员工体检等。
主要职责：学科规划、学位点申报评估、研究生招生、研究生教育、研究生管理、导师管理、学位委员会、就业指导、联培生管理、留学生管理等。
主要职责：经济管理体系、财务规划、资金经费管理、预算审核、收支核算及决算、日常财会等。
主要职责：对非经营性资产进行有效管理，包括房产、设备、办公家具等；负责各类采购（政府采购）管理及进口业务相关工作；负责大额科研材料监管等。
主要负责硬X射线自由电子激光装置项目的建设管理。
主要负责上海光源运行开放管理、上海光源线站工程、X射线自由电子激光试验装置、软X射线自由电子激光用户装置、质子治疗装置等项目的建设管理，负责上海光源用户委员会和学术委员会日常管理
主要负责蛋白质设施运行及维护升级管理，负责蛋白质设施用户委员会和科技委员会日常管理。
主要负责集群项目的质量与安全管理。
主要负责集群项目的经费、合同和招标工作管理。
主要负责集群项目相关信息、统计、宣传、人才、国际合作交流、档案等综合管理，负责大装置管理中心行政事务管理，负责与各职能部门相关协调工作。
主要职责：统筹管理信息和科研项目数据基础设施、信息化支撑、网络安全、园区通讯、网站及邮箱维护、文献情报等。
主要职责：辐射安全、化学安全、生物安全、消防及特种设备安全等技术支撑。
是集仪器设备运行维护、方法开发、技术服务及相应管理于一体的技术支撑部门。高研院内大型公共仪器设备实行“统一规划布局、统一运行管理”，发挥公共仪器设备在科研创新中的重要支撑作用。
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